中獸醫藥是我國獸醫藥學的寶貴遺產，是中華民族優秀文化遺產的重要組成部分，已有幾千年悠久的實踐歷史。長期以來，中獸醫藥對動物疾病的防治和畜牧業的健康發展作出了不可磨滅的貢獻。中獸醫藥行業應是以中獸醫為主，現在卻是步入缺醫差藥的窘境，全國當前中獸醫藥發展中存在的藥材資源不足、中獸藥產品良莠不齊、創新力量薄弱、中獸醫專業人才匱乏等問題突出，其實中獸醫藥發展危中有機，中獸醫藥在動物保健、食品安全、公共衛生安全、生態安全等方面起著重要作用。在國內中獸醫熱漸起，國際上越來越多的人開始認識、研究、應用中獸醫，中獸醫藥行業危中有機。
中醫藥已進入法制化發展道路，《中華人民共和國中醫藥法》于2017年7月1日起施行；而中獸醫藥除1956年發布過《國務院關于加強民間獸醫工作的指示》外，61年來從未有其他激勵政策出臺。在中醫方面，國家有中醫藥管理局，省、市、縣也都有相應的中醫藥管理機構，單廣東省省級中醫藥建設專項資金每年就有2億元左右；而中獸醫不僅沒有自己單獨的管理部門或機構，更沒有中獸醫藥建設專項資金，中獸醫課題項目投入的經費遠遠不及動物傳染病課題項目。2017年5月24日，國家科技管理信息系統公共服務平臺正式公示了2017年國家重點研發計劃8個重點專項擬立項項目清單。這8個重點專項主要集中在農業領域，共有140個項目入選，總經費超過38億元。其中“畜禽重大疫病防控與高效安全養殖綜合技術研發”重點專項2017年度擬立項項目23個，經費合計超過4.3億元，僅有1個中獸醫藥相關項目。我國動物防疫補助政策之一是重大動物疫病強制免疫疫苗補助政策。國家對高致病性禽流感、口蹄疫、高致病性豬藍耳病、豬瘟、小反芻獸疫等動物疫病實行強制免疫政策。強制免疫疫苗由省級財政部門會同省級畜牧獸醫行政主管部門統一補貼，養殖場（戶）無需支付疫苗費用。補助經費由中央和地方財政共同承擔。中央負擔部分采取一般轉移支付方式定額撥付地方。若中獸藥使用也有政策補助同樣也會推動中獸醫藥的產業發展。
現在普遍認可的是西醫的理論標準，它是以西方哲學和理化理論為基礎的。用這些標準來衡量中醫的成分和不良反應，當然很多是得不到滿意答案的。中獸醫學以陰陽、五行、臟腑和經絡學說為基本理論，并以氣、血、精、津、液為其活動的物質基礎。其特點是從整體觀念出發，按辨證論治原則進行畜病的診斷和治療，并以理、法、方、藥、針灸構成完整的學術體系。著重的是整體觀和辯證論治，不能用西醫的病原體、基因、分子理論去解釋，一個是微觀論，一個是宏觀論，沒有可比性。選錯了標尺，度量結果只會錯。應該讓中獸醫藥體系為廣大獸醫人員所接受（而不是排斥與否定），以利于祖國中獸醫的發展。
由于教育缺失，中獸醫藥學理論是愈來愈不好理解或不科學，“重藥輕醫”甚或“廢醫存藥”的思想日益蔓延，以至于中獸藥開發與應用中的復方綜合作用與辯證施治等根本特色與優勢考慮的愈來愈少，臨床療效也愈來愈差。現今中獸醫專業碩士與博士教育則主要是集中于中獸藥的研究，且大多是中獸藥西藥化的研究——更多地強調中獸藥的現代藥理學研究與認識，將化學單體物質的把握與認識看作是中獸藥的最高級研究，還可發SCI論文，而較少考慮辨證施治與復方綜合作用等中獸醫藥學的根本特點與優勢。現場能辨證施治的中獸醫鳳毛麟角。
在中醫方面，國內幾乎各省都有自己的中醫藥大學、研究院。反觀中獸醫，如今剩下的只有河北農業大學一個中獸醫學院、《中獸醫學雜志》與《中獸醫醫藥雜志》兩本雜志、一本教材、一門課，中獸醫教育體系不完整。中獸醫在美國受關注的程度遠遠要高于我國，在美國，利用針灸為寵物治病的獸醫從業者大約有8000人，反觀國內，在臨床使用熟練這項技術的估計不足100人。國際獸醫針灸學會（IVAS）對針灸課程的培訓達200學時，此外還有180學時的中藥培訓。而我國對于整個中獸醫課程的學習投入時間最長的中國農業大學也只不過才150學時。一門課，在不同的學校對中獸醫安排的課時不等，最少的竟然只有32個課時，32節課怎么會把這樣一套博大精深的中獸醫學完？！這樣淡化培養，遠遠不能滿足中獸醫人才需求，我國的中獸醫教育前景堪憂，后繼乏人。中獸醫的師承教育更無從談起。
辨證論治是中獸醫理、法、方、藥、針灸在臨床上的具體運用，通過五診（望、聞、問、切、驗）認識和判斷疾病的過程和方法。論治是根據病情確定標、本、緩、急的治療原則，并根據疾病情況選取汗、吐、下、和、溫、清、補、消等正確的治療方法。中獸藥的應用一定要在中獸醫理論的指導下進行，只有弄清病因、病位和病癥的陰陽表里寒熱虛實，才能做到藥證相應，藥到病除。當前，不少中獸醫者熱衷于單味藥的研究，臨床用藥時總是考慮其藥理成分，如抗炎、抗病毒、抗菌、抗腹瀉等，試圖通過其某種藥理作用而達到某種治療效果，而忽略了病變發生的背景及其病機過程，也沒有按中獸醫君臣佐使的合理組方。這種“對號入座”的“拼湊式”用藥，不能顯示中獸醫治病的規律和對動物疾病認識的全貌，顯然屬于舍本逐末，自然難以取效。
中、西藥物的作用模式有很大不同。西藥的化學實體為單一化合物，作用靶點較少且明確，具有較為專一的作用方式，對抗是其主要的作用機理。而中藥無論是單味還是復方，均含有多種成分，這些化學成分的作用并非簡單的疊加，而是相互影響、彌補，通過多層次、多個作用途徑、多靶點和機理發揮綜合作用。中獸藥取材于自然界的植物、動物與礦物，屬天然藥物。由于稟承不同、成分有別而具有“四氣”及“五味”之偏，走行去處（歸經）之別，藉此可用來糾正不同臟腑、經絡的疾病之偏，因而中獸藥治病的原理可概括為“以偏糾偏”。花大力氣花大價錢去研究如何把中獸藥西化、標準化其實是南轅北轍。中獸醫講究的是辯證論治，是追求療效而不是化學原理的，是根據動物不同的情況進行針對性診治，如果用標準化規定用藥用方，將動搖中獸醫藥的根本。如果讓中獸醫去模仿西醫，是走岐路。
藥材質量不穩定，沒有按GAP規范種植生產。國務院印發《關于取消13項國務院部門行政許可事項的決定》（國發〔2016〕10號）中規定，取消中藥材GAP認證。GAP的取消將會使監管部門的監管更加細致化、常態化和嚴格化。中藥材GAP認證檢查項目共104項，制定了保護野生藥材資源、生態環境和持續利用的實施方案；根據藥用植物生長發育要求制定相應的種植規程。藥材采收及初加工過程中排除非藥用部分及異物，特別是雜草及有毒物質，剔除破損、腐爛變質的部分。需干燥的中藥材采收后，及時采用適宜的方法和技術進行干燥，控制濕度和溫度，保證中藥材不受污染、有效成分不被破壞。適時采收、產地加工是保證藥材質量的要求，“三月茵陳四月蒿，五月采收當柴燒”，“當季是藥，越季為草”等等農諺是藥農在長期生產實踐中總結出的寶貴經驗。需運用先進的科學技術手段，加強中藥質量控制技術的研究，建立和完善中藥種植（養殖）、研究開發、生產銷售的標準和規范，保證中獸藥產品安全有效，質量可控。
中藥炮制的作用，有多方面降低或消除藥物的毒性或副作用，如川烏、巴豆改變或緩和藥性，如麻黃、蒲黃提高療效，如延胡索醋制、紫苑蜜制改變或增強藥物作用的部位和趨向；如大黃酒制、香附醋制便于調劑和制劑；如磁石、石決明等保證藥物凈度，利于儲藏；如鱉甲、桑螵蛸利于服用；如僵蠶麩炒、五靈脂醋制等。若處方中有萊菔子、牛蒡子、紫蘇子、王不留行、蒼耳子、牽牛子等果實種子類中藥，一般情況下應付炒黃品，使成分易于煎出或降低毒性，即所謂的“逢子必炒”；黃柏、杜仲等樹皮類中藥，一般情況下應付鹽制品，使藥物易入腎經，以治療腎經疾病。而現在的中獸藥效果不理想可能與缺乏炮制有關。
為了增強療效，行業里獸藥企業生產的中獸藥曾經不公開或不公開地大量加用西藥，中藥提取物僅是糊精加淀粉及色素通過高溫效應制出假中藥提取物，其特點價格比實際成本便宜很多！松針粉加花生秧粉碎成中獸藥保健藥等等。這些都是行業人士搬起石頭砸自己的腳，致使中獸藥的應用領域貌似不斷擴大，實則是日趨狹窄，這也是養豬場技術人員不敢相信中獸藥能治病的原因所在。
隨著抗生素的廣泛應用，隨之來也有許多新問題。應用抗生素治療疾病時常強調外因，不注重內因，不利于提高機體自身的抗病能力，對一些慢性傳染病也缺乏有效的治療藥物和手段。許多抗生素具有毒副作用，有的細菌會產生耐藥性,不能有效的治愈病畜，反而給病畜延誤了最佳治療時間。尤其是部分藥物殘留在畜產品中，影響了畜產品的質量，嚴重危及人民的身體健康。運用中獸醫理論飼養、繁育、防病和醫治畜禽，以毒副反應小，不易產生耐藥性，著眼于動物整體保健和治未病模式，強調調節整體功能，提高自身抗病力，在畜牧業生產的發展中大有可觀的前景。
中獸藥防治病毒一般以“清熱敗毒、扶正祛邪”為治則，常用含抗病毒活性因子的中獸藥如大青葉、板藍根、金銀花、連翹、射干、牛蒡子、黃連、穿心蓮、黃芩、黃柏、虎杖，野菊花、青黛、防風、蒲公英、魚腥草等來清熱敗毒，配以具有增強機體免疫功能的中獸藥如淫羊藿、黨參、黃芪、白術、山藥、甘草、當歸、刺五加等來扶正補氣血。如扶正解毒散的組方：板藍根、黃芪、淫羊藿。有扶正祛邪，清熱解毒，補腎益氣之功能。用于修復免疫細胞功能，誘導機體產生干擾素，調整機體免疫功能。
中獸藥對畜禽免疫調節作用主要包括：一是激活集體補體活性；二是促進機體抗體的生成；三是促進機體細胞免疫功能或增加免疫細胞數量；四是促進淋巴細胞轉化率；五是促進免疫器官如胸腺、脾臟等生長發育。中草藥，以多功能和調動機體一切抗病因素，即非特異免疫因素（白細胞吞噬作用，溶菌素、酶、殺菌素、干擾素、補體等），多方位對微生物進行滅殺，使之無力適應變異，故不易產生抗藥性。中獸藥如黃芪能提高機體免疫力，它是通過增強單核巨噬細胞的吞噬性，對體細胞，自然殺傷細胞釋放免疫活性物質、誘生干擾素、白細胞介素等來表現出多種生理活性的。中草藥的非特異免疫作用提示我們在篩選中獸藥的抗微生物作用是不能將體外試管抗菌作用作為唯一判定指標，需依從中獸醫理、法、方、藥的原則。
《中醫藥發展戰略規劃綱要（2016年～2030年）》對中藥材規范化的種植養殖進行了政策支持和鼓勵，它的出臺將利好藥材種植養殖企業，使中藥種植養殖迎來增長點。《中醫藥發展戰略規劃綱要》強調制定中藥材主產區種植區域規劃，制定國家道地藥材目錄，加強道地藥材良種繁育基地和規范化種植養殖基地建設，促進中藥材種植養殖業綠色發展；制定中藥材種植養殖、采集、儲藏技術標準，加強對中藥材種植養殖的科學引導，大力發展中藥材種植養殖專業合作社和合作聯社，提高規模化、規范化水平；建立完善中藥材原產地標記制度。如2017～2021年，廣東省財政安排嶺南中藥材保護資金1億元，其中2017年安排5760萬元。保護資金主要用于生產技術規范、種質庫圃及種源采集、文化保護、資源動態監測、種質資源圃建設、良種繁育基地建設、生產示范基地建設及技術推廣應用、品牌宣傳保護及注冊資助等。
過去的中獸藥制劑、水煎劑灌服，劑型單一粗糙，用藥劑量大，服用不方便，有的不同生產批號的制劑臨床效果差異很大，療效難以穩定，有的久置出現發霉、變質或分層、凝絮及變色等現象。質量控制多以外觀或主要成分含量為指標，難以保證其內在質量，顯然已不能很好的適應養殖業戰勝畜禽疾病的要求。因此，建議中獸藥企業多生產一些適合于群體給藥，最理想的長效緩釋制劑、控釋制劑，便于大范圍投藥的氣霧劑、透皮劑。此外，利用納米技術超微粉化藥物適用于控釋劑、吸入劑、鼻噴劑、以及植入式制劑等多種制劑。同時建議廣大畜禽養殖企業，運用中獸醫理論，在畜禽飼料中多添加一些綠色環保的中草藥成分，減少藥添加劑的使用。為我國畜產品開辟國際市場，參與國際市場競爭打開新的局面，促進畜牧業生產的發展再創新的輝煌。
我國古代遺留的中獸醫學專著十分豐富，公元前3?世紀的《黃帝內經》，2?世紀的《神農本草經》，漢代名醫張仲景著有《傷寒雜病論》和《金匱要略》，《漢書藝文志》中記載的《相六畜三十八卷》、《馬經》、《牛經》等，晉人葛洪所著《肘后備急方》，北魏賈思勰所著《齊民要術》，唐人李石著的《司牧安驥集》，明代著名的獸醫喻本元、喻本享所著的《元享療馬集》，李時珍的《本草綱目》，還有《抱犢集》、《串雅獸醫方》、《養耕集》、《活獸慈舟》、《牛經切要》、《豬經大全》等，為開展研究中獸醫學術的工作打下了堅定而扎實的基礎。
中獸醫藥教育需產學研互動，對學校與企業來講是一個“雙贏”，企業將得到最新技術的指導，解決實際生產中的技術難題；學校則鍛煉了教師，提高了教師中獸醫藥應用研究的水平，帶動學校整體辦學水平的提高，提升了學校的整體競爭力。
中獸藥研究思路的多樣化主要表現在以下幾個方面：首先，對藥材的研究，一般可以分為從生物學研究或者親緣關系研究，主要是為找到替代藥材，以彌補中藥材短缺現象，少與人醫爭藥材，降低中獸藥產品成本；其次，對藥性歸類及傳統用藥經驗的研究，產生了新的中藥材，被中獸醫所采用；再次，從中獸藥質量方面進行研究，主要是對生產中獸藥的流程研究以對控制其質量；等等。中獸醫與中獸藥研究還需同步化?，若是分開對中獸醫和中獸藥展開研究，那么就會造成獸醫不懂中獸藥，或者中獸藥不能夠被獸醫所用，不論哪一種都將導致中獸醫、中獸藥的消亡。只有把二者結合起來，才能取得效果。未來將會逐步加強中獸藥和中獸醫學的結合，把提高療效和提高藥材質量統一起來。只有做好中獸藥了才能得到中獸醫的好效果，進而有經濟和社會效益。
對于中獸醫而言，辯證是絕對的，辨病則是相對的。針對病因、病位、病狀三個方面處方用藥，針對三個方面用藥時，應相互呼應。例如：白虎湯證，癥見高熱口渴、出汗、脈洪大，陽明經證。但未見陽明腑實，故不宜改下，宜用甘寒滋潤，清熱生津。白虎湯證，病因為熱，病位為陽明經，病狀則為口渴、高熱、出汗、脈洪大。立法：清法。處方用藥：石膏、知母、粳米、甘草。在2006年高致病性藍耳病高發期，很多豬場應用白虎湯取得滿意效果。
中獸醫學“治未病”具有悠久的歷史，中獸醫在治未病法則指導下，創出了許多預防疾病的好方法。2000多年前的《周禮》、《詩經》和《山海經》載有人畜通用藥物100多種，并有“流赭（赭石）以涂牛馬無病”等獸醫專用藥物“治未病”的記載，以及《元亨療馬集·三飲三喂水論》的合理飼養管理預防疾病法。實踐證明，在這些在“未發”或“欲病”狀態的豬場，若及時地采用中草藥免疫增強劑進行“治未病”，就可避免這些傳染病的發生，那些衛生條件好和中草藥調理及時的豬場較少發生傳染病，而那些防疫和衛生條件差的豬場是多種傳染病的高發場所，各種傳染性疾病從未間斷。“治未病”——未病先防、既病防變的疫病防治理念充分反應出中獸醫學理論的基本精神，對現代動物疫病防控工作起著重要的指導作用。
總之，中獸醫學以其系統的理論體系，辯證論治的診療方法，獨特的藥性理論，“中獸醫思維弱化”，由之必然導致“學術異化”與“技術退化”。療效是中獸醫過去、現在以及未來賴以生存與發展的關鍵，而療效的獲取又必須建立在對理法方藥一體化的深刻理解、準確把握之上。毋庸置疑，中獸醫要想擺脫危機，實現復興，必須堅守特色，自信自強，加強中獸醫的臨床教育實踐，苦練內功，做好傳幫帶師承工作，才能在現代畜牧業中煥發出更鮮活的生命力！中國工程院院士、動物病毒學專家夏咸柱呼吁：“傳統中獸醫藥學是我國的寶庫，一定要繼承和發揚下去” 。行業要按照“創新、協調、綠色、開放、共享”的發展理念，統一思想、明確目標、齊心協力推動中獸醫藥產業持續發展。